Seminarios del IC - Dra. Silvia T. Cardona

Descubrir y desarrollar nuevos antibioticos: un enfoque interdisciplinario usando inteligencia artificial y quimioinformatica 

Dra. Silvia T. Cardona 

Department of Microbiology and Department of Medical Microbiology & Infectious Diseases, University of Manitoba

Jueves, 9 de marzo a las 14hs

Cero+Infinito, 1er piso, Salón  2119 (Esquina)

Resumen: 

La resistencia a los antibióticos es una grave amenaza para la salud pública en todo el mundo. La tasa de infecciones bacterianas resistentes está aumentando, superando en gran medida la tasa de descubrimiento de antibióticos. Con los métodos existentes para el descubrimiento de antibióticos, la posibilidad de encontrar un nuevo fármaco que elimine las bacterias es extremadamente baja. Existen dos desafíos fundamentales: 1) aumentar el número inicial de compuestos activos o “hits” en campañas de testeo inicial a larga escala o “high throughput screening”, 2) Dilucidar el mecanismo de acción y el componente bacteriano sobre el cual un compuesto nuevo actúa. 

Nuestra investigación tiene como objetivo agilizar la identificación de compuestos químicos con actividad antibiótica frente a bacterias junto con la determinación de su mecanismo de acción. Con este fin, formamos un grupo interdisciplinario con especialidad en inteligencia artificial y quimio informática. Específicamente, usamos aprendizaje profundo o “deep learning” para describir las propiedades químicas de los compuestos que tienen actividad antibacteriana y luego predecimos que compuestos podrían mostrar esa actividad en bibliotecas virtuales de moléculas pequeñas o “small molecule virtual libraries”. Usando este método, hemos aumentado la tasa de éxito o “hit rate” en campañas de testeo inicial.